Durante el período de 7:00 a.m. del 6 de junio a 7:00 a.m. del 7 de junio de 2016, la red de estaciones telemétricas de monitoreo del Ministerio de Medio Ambiente y Recursos Naturales (MARN) registró precipitaciones dispersas en la cadena volcánica, al sur del territorio nacional, con intensidades de débil a moderada. El máximo acumulado de lluvia registrado es de 34.2mm en la estación Hacienda Melara, departamento de La Libertad.

Las condiciones meteorológicas pronostican actividad eléctrica chubascosa y tormentas dispersas con énfasis en franja norte y cadena volcánica del país. 

De acuerdo a las condiciones de humedad precedentes en los suelos, la lluvia registrada en los últimos días y las precipitaciones pronosticadas, se prevé una alta probabilidad a desbordamientos en la red hídrica de los ríos: Grande de San Miguel, Goascorán, Sirama y región hidrográfica de Bahía de Jiquilisco.

Para el resto del territorio nacional la probabilidad a desbordamientos es de baja a moderada. No se descarta la ocurrencia de lluvias intensas que puedan ocasionar afectaciones urbanas en los departamentos de Santa Ana, Ahuachapán, Sonsonate, San Salvador, Usulután, San Miguel y La Unión.

Río Lempa
Baja probabilidad de desbordamiento en el cauce principal.

Río Grande de San Miguel
Alta probabilidad de desbordamiento en el cauce principal, pudiendo afectar algunas comunidades en la parte baja de la cuenca. Atención especial a región hidrográfica de Bahía de Jiquilisco en donde se prevé Alta probabilidad a desbordamiento

Río Goascorán
Alta probabilidad de desbordamiento en el cauce principal. Atención a ríos y quebradas de corto recorrido que drenan de las zonas altas y montañosas de la cuenca. Se reportan leves desbordamientos afectando potreros en el municipio Piedras Blancas, en Los Carpules y el Naranjo. No se descarta que ríos de corto recorrido que drenan del Volcán de Conchagua registren crecidas repentinas.

Río Jiboa
Baja probabilidad de desbordamiento en el cauce principal. Ríos y quebradas de corto recorrido que drenan al Estero Jaltepeque con Moderada probabilidad a desbordamiento.

Río Paz
Moderada probabilidad de desbordamiento en el cauce principal. Atención especial a ríos de corto recorrido que drenan de la cordillera Santa Ana – Ilamatepec. Tales como: Cara Sucia, San francisco, Sacramento, Cuilapa, El Naranjo y San Pedro, por la ocurrencia de crecidas repentinas.